La Auditoría Médica en la Clínica El Rosario se encarga de verificar el cumplimiento normativo y compromisos con aseguradoras, basándose en la medicina basada en la evidencia. Este equipo realiza actividades como auditoría concurrente, conciliación de facturación, diseño de indicadores de gestión, y participación en comités para optimizar procesos. Su labor busca detectar inconsistencias en la atención de salud, beneficiando a todos los actores del sistema y asegurando la transparencia en la relación con el asegurador. Los auditores, guiados por valores institucionales, trabajan con honestidad, respeto y responsabilidad. Las oficinas de auditoría interna están ubicadas en las sedes El Tesoro y Centro.